La nouvelle équipe des Gardiens de la galaxie, formée de Peter Quill, Rocket, Drax, Gamora et Bébé Groot, terrasse un monstre qui menaçait le stock de piles nécessaire à la survie du peuple des Souverains. En guise de récompense, la prêtresse Ayesha livre aux justiciers Nebula, la soeur maléfique de Gamora. Mais avant de partir, le fantasque Rocket vole un lot de piles à la souveraine. Outrée, cette dernière lance sa flotte à la poursuite des Gardiens. Se produit alors un curieux phénomène magnétique, qui détruit toute l'armada et permet à l'appareil des fugitifs de traverser un portail pour se retrouver en lieu sûr. Ce prodigieux sauvetage est l'oeuvre d'Ego, un être céleste et tout-puissant qui prétend être le père de Peter. Bien qu'incrédule, ce dernier, flanqué de Gamora et Drax, accompagne ce dieu sur une planète de sa création, où il lui dévoile son ambitieux projet cosmique. Pendant ce temps, Rocket et Bébé Groot s'affairent à réparer le vaisseau lourdement endommagé, tout en surveillant de près Nebula.