Une unité secrète de l'armée américaine combat les Decepticons, des robots extraterrestres polymorphes aux instincts destructeurs, avec l'aide des ennemis de ces derniers, les Autobots, commandés par le puissant Optimus Prime. Mais par malheur, ce dernier a rendu l'âme au cours d'un affrontement où il a sauvé la vie de l'étudiant Sam Witwicky, son ami humain. En compagnie de sa copine mécanicienne, de son compagnon de chambre trouillard et d'un ancien agent du gouvernement avec qui il a eu jadis maille à partir, Sam se rend en Égypte afin de trouver la matrice du pouvoir, un artefact capable de ressusciter Optimus. Mais ladite matrice est également convoitée par un Decepticon assoiffé de vengeance, qui veut l'utiliser pour activer une machine pouvant détruire le soleil et ainsi anéantir la race humaine.