Deux monstres, King Kong, le gorille géant, et Godzilla, un animal préhistorique, reprennent vie et menacent de détruire le Japon. Avec la collaboration des Nations unies et des plus grands savants de l'univers, l'armée japonaise essaie par tous les moyens - la bombe atomique exceptée -, de se défaire, à tour de rôle, de ces êtres dangereux qui détruisent tout sur leur passage. Devant l'inefficacité des armes les plus modernes, on décide de faire se rencontrer et s'affronter les deux monstres. La bataille qui s'ensuit sauve le Japon de la destruction.